脑囊虫病临床分为四型：
1） 脑实质型：临床症状与包囊位置有关，皮质包囊可引起全身性和部分性癫痫发作，突然或缓慢出现偏瘫、感觉丧失、偏盲和失语等；小脑包囊引起共济失调，血管受累可引起卒中，极少数分布于额叶或颞叶可引起痴呆。
2） 蛛网膜（或脑膜）型：脑膜包囊破裂或死亡可引起头痛、交通性脑积水和脑膜炎等表现；基底池包囊可引起梗阻性脑积水；累及脊髓蛛网膜出现蛛网膜和蛛网膜下腔梗阻。
3） 脑室型：第三、四脑室包囊可引起梗阻性脑积水。
4） 脊髓型：罕见，多出现颈胸髓损害表现。
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